Diergaarde Blijdorp is ook een botanische tuin.  Dat zie je niet alleen terug in de landschapsinrichting, Blijdorp beheert ook de wetenschappelijke nationale bromelia-collectie en de primula collectie. Een van de belangrijkste doelstellingen is het instand houden, beheren en uitbreiden van de plantencollectie binnen de dierentuin.

Jaarlijks wordt een zadenlijst (Index seminum) samengesteld en uitgewisseld met verschillende botanische tuinen en aanverwante instellingen over de hele wereld. Hierdoor krijgt elke botanische tuin de kans om haar collectie uit te breiden.

Tussen de Oewanje speeltuin & de Afrikaanse savanne ligt een kassencomplex waar u exotische vogels en planten, maar ook vlinders kunt bewonderen. Tevens wordt hier een deel van de wetenschappelijke Bromelia-collectie tentoongesteld, die onderdeel uitmaakt van de Nationale Plantencollectie (NP).